赤峰市妇幼保健院2011年被自治区卫健委正式批准成为内蒙古自治区新生儿疾病筛查赤峰分中心，2014年被自治区卫健委正式批准成为内蒙古自治区产前诊断赤峰分中心。
检验科承担着内蒙古东六盟新生儿疾病筛查和产前筛查与产前诊断质量控制与技术指导工作，目前检验科共接收赤峰市十二个旗县区38家助产机构的新生儿疾病筛查标本和26家助产机构的产前血清学筛查标本，同时也承担着赤峰市产前诊断的实验室检测工作，包括介入性产前诊断技术和遗传学的诊断技术，建立了赤峰地区的新筛与产筛信息网络，实现了网络全覆盖。检验科现有人员16人，其中硕士研究生 1 人，本科 15人；主任检验师 1名，副主任检验师 2 人，中级 9 人，初级 4人。
检验科位于住院楼二楼和门诊楼三楼，共计一千三百㎡，设置有中心实验室、新生儿疾病筛查实验室、产前筛查实验室、细胞遗传实验室、微生物实验室、HIV初筛实验室及PCR实验室，开展检验项目150余项，大型设备五十余台：羊水胎儿细胞培养设备、羊水染色体分析系统、产前筛查设备、美国PE1420荧光分析仪、串联质谱仪、PCR扩增仪、测序仪等。科室实现信息化管理，门诊采用自助打印方式报告结果。住院患者检验结果采用自动传输至医生工作站。
检验科在医院领导的大力支持下，在医院科技兴院的良好环境中正快速、稳步发展。
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